More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2672 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  53.68 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  48.24 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  30.26 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 324 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  27.51 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  25 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  30.22 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 497 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>