More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5861 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  35.71 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  67.24 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  40.29 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  28.65 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  45.05 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  35.35 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  42.47 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  40.7 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  31.72 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>