More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0291 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  54.84 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  42.52 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  33.53 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  35.47 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  58.93 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  29.51 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  35.21 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  38.17 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.36 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  58.14 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>