More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1156 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 194 aa  265  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  65.26 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  60.73 
 
 		 192 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  60.73 
 
 		 192 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 215 aa  223  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 191 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 248 aa  71.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  50.68 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  40.62 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  47.42 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  61.4 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  45.98 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  28.47 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 262 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>