More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1028 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  100 
 
 
262 aa  523  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  40.09 
 
 
236 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  49.4 
 
 
247 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
233 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
237 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  39.76 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
205 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.36 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  32.58 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
203 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
191 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
191 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
191 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 
210 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
205 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 
215 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
207 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 
188 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  56.36 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  45.26 
 
 
199 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 
192 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  34.78 
 
 
188 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
198 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  37.4 
 
 
186 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
200 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 
195 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
194 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  32.09 
 
 
183 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
186 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
187 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  34.15 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
192 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
200 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
190 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
191 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
223 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 
202 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  50 
 
 
200 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  29.06 
 
 
181 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 
197 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  33.61 
 
 
208 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
198 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
198 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
198 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
203 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  30.58 
 
 
198 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 
198 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  58.7 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
200 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 
197 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 
192 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
209 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  56.82 
 
 
192 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  56.82 
 
 
192 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
199 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 
217 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05630  transcriptional regulator  37.5 
 
 
90 aa  52.4  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
192 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
202 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
209 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
201 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 
205 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
199 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  32.06 
 
 
200 aa  52.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
199 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
199 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
201 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
213 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
209 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
198 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>