270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3333 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 246 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  41.75 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  46.32 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 252 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  33.09 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 280 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  44.83 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  43.1 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  44.83 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>