More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1772 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 396 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 438 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 385 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  45.45 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 287 aa  51.2  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  28.93 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  37.1 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  34.57 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 424 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  25.86 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  30.7 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.14 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>