More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2723 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  100 
 
 		 198 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  36.92 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  36.04 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 235 aa  95.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 187 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 213 aa  85.1  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  31.13 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1851  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  42.31 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  37.93 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  39.34 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>