More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3205 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  38.5 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 160 aa  91.3  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 309 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 400 aa  84.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  38.41 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  33.76 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 388 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 406 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 285 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 394 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 394 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 394 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  30.57 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 396 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  35.11 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>