More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0030 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  94.82 
 
 		 193 aa  336  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  70.65 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  52.07 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  47.59 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  49.73 
 
 		 196 aa  157  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 206 aa  151  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  51.65 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  50.71 
 
 		 220 aa  137  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  51.5 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  48.47 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  47.4 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  44.31 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  45.39 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 363 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 425 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 400 aa  94.7  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 309 aa  94.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  34.42 
 
 		 403 aa  91.3  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 410 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34.27 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 385 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 451 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 428 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 451 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 412 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  30.84 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.82 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  34.38 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  48.21 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>