More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1353 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  53.89 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  46.56 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  50.3 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  50.3 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  47.8 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  50.3 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 195 aa  138  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 182 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  49.38 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  45.62 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  45.52 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.43 
 
 		 390 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  25 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 451 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 451 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 406 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 412 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 412 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 394 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 394 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 412 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 394 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 385 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>