More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2067 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  55.5 
 
 		 211 aa  224  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  56.92 
 
 		 198 aa  214  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  44.88 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  36.2 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  34.55 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  34.67 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  34 
 
 		 197 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  32.22 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  37.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  37.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  37.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  37.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  37.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  37.08 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  37.08 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  25.9 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  30.99 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  32.22 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  26.63 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  38.6 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 677 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  23.57 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  34.25 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  34.25 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  34.25 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  31.31 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  31.34 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  25 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  36.51 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  36.51 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 335 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>