210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0346 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 220 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1789  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00598195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  29.7 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  29.51 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  29.89 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  21.85 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 408 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  28.48 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  33.66 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 230 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25 
 
 		 251 aa  44.7  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 445 aa  44.7  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>