153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2557 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  40 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28950  Transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  32.74 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  30.3 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  30.34 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  39.02 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.88 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 424 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  37.29 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 393 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  41.1 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  40.68 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  34.48 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  37.93 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>