56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18430 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  26.98 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 256 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 98 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 218 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 251 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 425 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 204 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>