146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3333 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  64.91 
 
 		 221 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  66.83 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  56.77 
 
 		 221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  50.66 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  36.77 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  38.81 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  28.89 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  34.15 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.78 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  36.07 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.18 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.73 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 260 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  28.57 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  27.78 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>