More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2113 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  53.67 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
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NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
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NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 178 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
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NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
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NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 175 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  34.71 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
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NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
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NC_013172  Bfae_31090  transcriptional regulator, tetR family  38.26 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.565118  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 428 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
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NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 415 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  29.24 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  35.56 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  35.56 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  35.56 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  35.56 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
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NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
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NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 247 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.44 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.25 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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