34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2324 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  36.4 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28950  Transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  26.2 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.92 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0233  hypothetical protein  26.53 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 200 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 200 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 232 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 196 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 200 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>