More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1493 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 198 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 198 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  37.43 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  44.8 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.94 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  34.07 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  34.07 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  34.53 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  25.61 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  25.61 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  25.61 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25.61 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25.61 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25.61 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25.61 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  35.29 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>