More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2513 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  48.9 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  48.35 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  30 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  32.23 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  31.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  31.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  31.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  31.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  31.58 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  31.58 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  38.6 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  43.55 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  41.67 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  29.49 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 		 278 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  44.23 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  26.29 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>