More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0074 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 
206 aa  104  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
206 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
125 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  31.25 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
242 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
223 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.7 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.23 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.23 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.23 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.23 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.23 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
219 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 
223 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  26.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  26.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.7 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
231 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  39.74 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 
286 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
210 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  31.15 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.57 
 
 
217 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  31.15 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  31.15 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
231 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
87 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  31.15 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  31.15 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  31.15 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
235 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
242 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
207 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  58.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 
217 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 
291 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>