More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5773 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  95.45 
 
 		 198 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 223 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.89 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.91 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.91 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  27.91 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  27.91 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  27.91 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  27.91 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.95 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  30.93 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  28.89 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  28.48 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  34.53 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  26.32 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  34.07 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  34.07 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  40.37 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  40.37 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>