More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3722 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  80.6 
 
 		 201 aa  330  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  78.61 
 
 		 201 aa  330  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 200 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 200 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  74.5 
 
 		 200 aa  291  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  53 
 
 		 199 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 200 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 234 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 237 aa  85.9  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  33.53 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  47.95 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  47.95 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  47.95 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  47.95 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  47.95 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  47.95 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  46.58 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  53.12 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  56.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4766  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 87 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  53.85 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>