More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4373 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  67.26 
 
 		 227 aa  300  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  64.19 
 
 		 233 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  58.33 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 200 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 196 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  33.02 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  30.14 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  31.11 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  30.48 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  26.74 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1213  regulatory protein TetR  27.45 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  24.21 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 335 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  40.38 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  40.38 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>