More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0397 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  407  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.04 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  35.48 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  31.65 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  21.8 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  42.19 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 261 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  22.05 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 257 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  30 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  45.9 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  32.03 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  19.71 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>