More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1264 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  80.3 
 
 		 205 aa  332  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  77.45 
 
 		 205 aa  322  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  65.2 
 
 		 206 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 206 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 206 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 212 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  64.53 
 
 		 206 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 206 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  64.22 
 
 		 206 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 187 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 175 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  31.28 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  49.37 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  44.62 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.31 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>