More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5987 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  41.87 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  40.56 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 226 aa  91.3  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  33.01 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  50 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  46.15 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  46.15 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  46.15 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  46.15 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  46.15 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  46.15 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>