More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1632 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 239 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  51.47 
 
 		 195 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  46.55 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  50.79 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.11 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  40.68 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>