More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4194 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  89.05 
 
 		 201 aa  364  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  78.61 
 
 		 202 aa  330  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  78.61 
 
 		 202 aa  330  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  78.11 
 
 		 202 aa  328  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 200 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  74.5 
 
 		 200 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  74.5 
 
 		 200 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  55.5 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  55.5 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  55.5 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 199 aa  207  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 234 aa  185  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  56.25 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  27 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  56.25 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  53.12 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  43.84 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  28.98 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  43.84 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>