More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0027 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
209 aa  423  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  90.38 
 
 
269 aa  388  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
233 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
324 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  44.93 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  44.93 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  44.93 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.93 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  45.59 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  44.93 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  37.41 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  30.41 
 
 
211 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  26.55 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  26.55 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
224 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 
190 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.89 
 
 
252 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal 
 
 
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NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.09 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
190 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
209 aa  61.6  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
196 aa  61.6  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
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