More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1738 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  92.23 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  91.71 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  92.2 
 
 		 206 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  90.29 
 
 		 206 aa  363  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 212 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  71.84 
 
 		 206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  288  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 205 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  64.04 
 
 		 205 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 237 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  32.35 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  58.21 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  28 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 394 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 394 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 394 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.5 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.5 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.5 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.5 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.5 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>