More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1428 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 237 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 226 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  26.01 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  37.21 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  38.36 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  33.93 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
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NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  43.86 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
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NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
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