More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2461 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  85.93 
 
 		 200 aa  332  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 202 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 200 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 200 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  32.68 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  43.84 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8868  putative transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  43.84 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.85 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  36.62 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  43.84 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  43.75 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>