More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8868 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8868  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 237 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  28.17 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.17 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.34 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.17 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  28.17 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.17 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  28.17 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  28.17 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 307 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  27.96 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  29.9 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  25.76 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
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NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  41.33 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
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