More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5815 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  96.6 
 
 		 206 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  48.28 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 205 aa  177  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  30.29 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  46.34 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  50.85 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  45.57 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8868  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  52.54 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>