More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5812 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 175 aa  201  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  35.38 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  40.94 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  37.4 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  48.28 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 374 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 242 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  39.13 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  40 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>