More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0167 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  29.36 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  28.7 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  25.32 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  22.52 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>