More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5257 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  50.48 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  56.02 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  43.81 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  35.6 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  39.59 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 195 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  32.22 
 
 		 197 aa  84.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  33.52 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.2 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.79 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.79 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5365  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.79 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.79 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.79 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.96 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>