More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2161 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  96.12 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  72.2 
 
 		 206 aa  290  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  72.68 
 
 		 206 aa  290  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  71.36 
 
 		 206 aa  288  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  70.39 
 
 		 206 aa  288  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 206 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  62.07 
 
 		 205 aa  258  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 225 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  43.08 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.26 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  32.05 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.19 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>