More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2337 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  49.17 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  40.23 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  43.71 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  33.89 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  55 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  39.08 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  41.89 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  28.78 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  28.06 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  28.06 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  28.06 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  28.72 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  44.94 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  38.6 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  29.29 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>