More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5279 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  34.95 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  34.75 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  41.56 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  37.6 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 87 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  29.38 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  29.45 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  32 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  39.47 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  41.27 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>