More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0669 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31770  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  95.5  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  25.95 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  29.44 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.14 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  30.69 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  29.14 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  55.1 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 178 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 177 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  28.07 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  35.56 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  37.33 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 186 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  30.83 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  43.1 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  43.1 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  43.1 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 182 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  43.1 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  43.1 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  43.1 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>