More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3825 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  100 
 
 		 203 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  60.11 
 
 		 202 aa  214  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  57.67 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  52.85 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  51.32 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  44.56 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  34.03 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  36.17 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  28.79 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 335 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  30.89 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 74 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 332 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 429 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0270  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  29.27 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  27.04 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  40 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>