More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2002 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 178 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 184 aa  94.4  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 168 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  36.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  28.57 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  37.7 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 415 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0270  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  31.82 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  38.98 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  25.32 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  31.82 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 428 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 269 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  25.35 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 219 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 209 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>