More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 181 aa  359  9e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  53.67 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  53.98 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  46.11 
 
 		 190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  31.41 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 428 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  46.3 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  29.09 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 		 242 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  46.15 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  39.58 
 
 		 209 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 192 aa  50.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 285 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>