More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0953 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 192 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 415 aa  72  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  28.81 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 428 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  32.95 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 268 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  33.33 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 243 aa  51.6  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  30.63 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 183 aa  47.8  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 219 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3661  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 306 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 221 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 357 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>