More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0872 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  78.49 
 
 		 187 aa  312  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 188 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  40.53 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  37.63 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  56.41 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 244 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 227 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.56 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  24.22 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.59 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.59 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.59 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.59 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.59 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.23 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.59 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 230 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 415 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  29.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>