More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6061 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  99.48 
 
 		 227 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  97.91 
 
 		 227 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  87.83 
 
 		 236 aa  328  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  87.7 
 
 		 201 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  87.3 
 
 		 244 aa  309  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  86.03 
 
 		 185 aa  289  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  32.47 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 168 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  45.98 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 168 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  46.67 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
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NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
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NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  49.15 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  37.7 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.36 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  31.12 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 291 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 245 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 335 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
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NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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