More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4107 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  92.97 
 
 		 186 aa  344  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  70.22 
 
 		 181 aa  269  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  50.28 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 415 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 428 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  31.49 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 357 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  33.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  33.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  37.29 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  57.45 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  28.12 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  31.67 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>