More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3878 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  373  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.53 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.1 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.66 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  57.45 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  57.45 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 428 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  30.64 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 244 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  25.93 
 
 		 246 aa  48.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 230 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 250 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  38.81 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 453 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  35.56 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>